Caracterização da região intergênica 16S-23S rRNA de bactérias associativas de arroz (Oryza sativa L.)

Resumo

A região intergênica entre os genes 16S e 23S rRNA é considerada uma região variável do genoma bacteriano e tem sido utilizada para estimar a diversidade de microrganismos. O objetivo desse estudo foi caracterizar genotipicamente 22 bactérias associativas de arroz (Oryza sativa L.), pela análise da região espaçadora intergênica (16S-23S rRNA) (IGS). A caracterização genotípica foi realizada pela técnica de PCR utilizando os oligonucleotídeos pHRf e p23Sr para avaliar a região IGS. Através da análise do perfil eletroforético dos produtos obtidos da PCR, foi observada a variação dos fragmentos de número, com 1 a 5, de tamanho entre 0,5 a 3 kpb. A maioria dos isolados de arroz avaliados apresentaram pelo menos três operons de rRNA. Pela análise do dendrograma foram identificados sete grupos com índice de similaridade de 50%. Foi observado que os isolados de arroz avaliados apresentam diversidade genotípica, já que quatro dos sete grupos apresentaram características únicas entre os isolados. Ainda, através dessa análise, foi possível identificar que apenas alguns isolados apresentaram uma relação estreita com a família Rhizobiaceae. Desse modo, a análise utilizando o gene marcador para região IGS permitiu observar a variabilidade genética presente em bactérias associadas a plantas de arroz cultivada no Cerrado.